Samotný král Jindřich VI. se jí však nezúčastnil, neboť nečekaně zemřel krátce před svým odjezdem v Messině 28. září1197. V Říši napjaté vztahy mezi Štaufy a Welfy zosobněné Filipem Švábským a Otou IV. Brunšvickým přerostly do otevřeného soupeření o moc. Mnozí účastníci kruciáty proto svou účast na tažení ihned přerušili a spěchali do Německa, aby ochránili své postavení a zájmy. Zbylí křižáci připluli do Svaté země a podařilo se jim dobýt pobřeží mezi Týrem a Tripolisem, které bylo nyní v muslimských rukou. Po dobytí měst Sidónu a Bejrútu byla výprava ukončena. Získaná města a území byla navrácena Jeruzalémskému království, k němuž ještě donedávna patřila, lze tedy výpravu považovat za úspěšnou.