Po skončení hráčské kariéry se stal fotbalovým trenérem. Se Slovanem Bratislava získal v roce 1992 československý titul, po vzniku samostatné slovenské ligy s ním pak získal i tři tituly slovenské a Slovenský pohár. Ten získal posléze i jako trenér Spartaku Trnava. V letech 2003–2006 byl trenér slovenské reprezentace. Přivedl své mužstvo do baráže o postup na mistrovství světa 2006, tam však neuspělo. V srpnu 2013 přijal nabídku Slovanu Bratislava a vrátil se k A-mužstvu, kde posílil bez nároku na finanční odměnu trenérský tým (Valovič, Kontír). Vedení klubu proklamovalo, že by to mělo být pouze dočasné řešení, zároveň nevyloučilo jeho možné setrvání do konce sezóny.[2]
