UvrABC endonukleáza

UvrABC(D) endonukleáza je bakteriální multienzymový komplex vyskytující se v E. coli a účastnící se postreplikační reparace DNA, při tzv. postreplikační excizi nukleotidů. Proto se taky někdy nazývá excinukleáza. Jedná se o opravný proces, který zahrnuje vyštěpení 12 nukleotidů, v místě výskytu genové mutace, a kompletizaci opravy DNA doplněním správný sekvence nukleotidů. Tento enzym je schopný oprav různého typu a velikosti poškození, včetně formace cyklobutylového dimeru.

Mechanismus funkce

Dva UvrA proteiny formují dimer. Oba mají ATPázovou/GTPázovou aktivitu.
UvrA dimer se váže na UvrB a spolu formují trimer, který je schopný detekce poškození na DNA řetězci. UvrA dimer je zodpovědný za rozpoznání poškození DNA řetězce, pravděpodobně mechanismem detekce deformací helixu DNA.
UvrB podjednotka se připojí k helixu na straně poškození.
UvrA dimer se následně odpojí a místo něho se napojí UvrC proteinová podjednotka a vytvoří tak nový UvrBC dimer. Tento dimer je zodpovědný za rozštěpení poškozené části sekvence nukleotidů. UvrB rozštěpí fosfodiesterové vazby čtyř nukleotidů v místě mutace a UvrC rozštěpí fosfodiesterové vazby dalších osmi nukleotidů v tomto místě, ale opačným směrem. Vznikne tak sekvence 12 nukleotidů, které jsou vyštěpeny z řetězce.
DNA helikáza II (někdy také označovaná jako UvrD jednotka)odstraňuje vyštěpený segment odstraněním párování bází. UvrB je stále navázaná na svém místě, i když UvrC oddisociovala, protože má pravděpodobně úlohu zabránit opětovnému spojení vyštěpené DNA k „zdravému“ řetězci.
DNA polymeráza I současně hned doplní prázdné místo správnou sekvencí nukleotidů, zruší vazbu UvrB na DNA a poslední fosfodiesterovou vazbu kompletizuje DNA ligáza.

Reference

V tomto článku byl použit překlad textu z článku UvrABC endonuclease na anglické Wikipedii.

Související články