Přeskočit na obsah

Gemmatimonadota

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Jak číst taxoboxGemmatimonadetes
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
Doménabakterie (Bacteria)
KmenGemmatimonadota
Zhang a kol. 2003
třídy

Gemmatimonadetes (Zhang a kol., 2003) Longimicrobia (Pascual a kol. 2016)

Některá data mohou pocházet z datové položky.

Bakteriální kmen Gemmatimonadota[1][2] byl formálně ustaven v roce 2003. Do současné doby obsahuje pouze pět popsaných druhů a dělí se do 2 tříd: Gemmatimonadetes a Longimicrobia. Jeho zástupci jsou aerobní a semiaerobní heterotrofní organismy. Gemmatimonadota jsou relativně běžnou složkou půdních mikrobiálních společenstev, kde tvoří 1–2 % přítomných bakterií. Nachází se také ve sladkých vodách, čistírnách odpadních vod a sedimentech.

Popsané druhy

[editovat | editovat zdroj]

První druh kmene Gemmatimonadota bakterie Gemmatimonas aurantiaca T-27T byla popsána roku 2003. Tato gramnegativní, tyčinkovitá a aerobní bakterie byla kultivován z aktivovaného kalu čističky odpadních vod.[3] Druhým popsaným druhem byla roku 2013 bakterie Gemmatirosa kalamazoonensis KBS708, která byla izolována z organicky obdělávané půdy v Michiganu v USA.[4]

Dalším popsaným druhem byla Gemmatimonas phototrophica AP64T, která byla roku 2014 izolována z mělkého sladkovodního jezera Tiān é hú nacházejícím se v čínské provincii Vnitřní Mongolsko[5]. Unikátní vlastností tohoto organismu je přítomnost fotosyntetických reakčních center. Tento organismus pravděpodobně získal své fotosyntetické geny horizontálním přenosem z fototrofních Proteobakterií. G. phototrophica je fakultativní fotoheterotrof. Pro svůj růst potřebuje přísun organických látek, ale je schopen pokrýt velkou část svých metabolických potřeb pomocí světelné energie.[6]

Bakterie Longimicrobium terrae CB-286315T byla izolována ze vzorku lesní půdy poblíž španělské Granady. Vzhledem ke své značné fylogenetické odlišnosti ustavila roku 2016 i novou třídu nazvanou Longimicrobia.[7] Posledním kultivovaným zástupcem Gemmatimonadota je Roseisolibacter agri AW1220T izolovaný ze zemědělské půdy v Namibii.[8]

  1. OREN, Aharon; GARRITY, George M. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [online]. 2021-10-20 [cit. 2024-03-25]. Roč. 71, čís. 10. DOI 10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. (anglicky) 
  2. LPSN. Domain Bacteria. Dostupné online (anglicky)
  3. Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov.. Int J Syst Evol Microbiol. 2003, roč. 53, čís. Pt 4, s. 1155–63. Dostupné v archivu pořízeném dne 2008-06-07.  Archivováno 7. 6. 2008 na Wayback Machine.
  4. DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. Gemmatirosa kalamazoonesis gen. nov., sp. nov., a member of the rarelycultivated bacterial phylum Gemmatimonadetes.. J Gen Appl Microbiol. 2013, roč. 59, s. 305–312. 
  5. Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca.. Int J Syst Evol Microbiol. 2015, roč. 65, s. 2410–2419. 
  6. Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes.. Proc Natl Acad Sci USA. 2014, roč. 111, s. 7795–7800. 
  7. Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. Longimicrobium terrae gen. nov., sp. nov., a novel oligotrophic bacterium of the underrepresented phylum Gemmatimonadetes isolated through a system of miniaturized diffusion chambers.. Int J Syst Evol Microbiol. 2016, roč. 66, s. 1976–1985. 
  8. PASCUAL, J., Foesel B.U., Geppert A., Huber K.J., Boedeker C., Luckner M., Wanner G., Overmann J. Roseisolibacter agri gen. nov., sp. nov., a novel slow-growing member of the under-represented phylum Gemmatimonadetes. Int J Syst Evol Microbiol. 2018, roč. 68, s. 1028–1036. 

Externí odkazy

[editovat | editovat zdroj]